More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001286 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001286  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  100 
 
 
344 aa  705    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 
348 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  56.43 
 
 
348 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.43 
 
 
348 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.43 
 
 
348 aa  391  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.28 
 
 
348 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4478  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.15 
 
 
356 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  52.68 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 
348 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0060  ATPase domain-containing protein  54.44 
 
 
348 aa  349  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.14 
 
 
348 aa  345  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
891 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  37.8 
 
 
886 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  31.05 
 
 
356 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
886 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
884 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
884 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
884 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
884 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  39.64 
 
 
874 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
883 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  36.36 
 
 
913 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  34.76 
 
 
905 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
907 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
356 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  38.4 
 
 
885 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  37 
 
 
914 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  38.82 
 
 
885 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
887 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
342 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  39.24 
 
 
887 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
907 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.82 
 
 
885 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  33.05 
 
 
907 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
890 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
888 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
912 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
897 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
889 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
901 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
892 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
902 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.33 
 
 
902 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
887 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
887 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
900 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
897 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  32.28 
 
 
910 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
867 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
897 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  34.75 
 
 
902 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
867 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
896 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
905 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
894 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
522 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
905 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  30.54 
 
 
539 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  31.48 
 
 
905 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
902 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
907 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
902 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  29.35 
 
 
906 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  29.6 
 
 
488 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
530 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  32.14 
 
 
530 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
639 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  31.25 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
639 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  31.88 
 
 
937 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
895 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
900 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  32.3 
 
 
231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
961 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  30.47 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
600 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  33.78 
 
 
511 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
620 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  29.89 
 
 
371 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1460  ATP-binding region ATPase domain protein  25.24 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  28.29 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  28.15 
 
 
900 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
737 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.65 
 
 
895 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3764  histidine kinase  30.54 
 
 
545 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
641 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  28.96 
 
 
850 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
1519 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
640 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30 
 
 
926 aa  109  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  29.01 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>