More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001278 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  88.79 
 
 		 576 aa  1001    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  100 
 
 		 535 aa  1098    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.75 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  39.54 
 
 		 580 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  39.69 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.33 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.64 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.15 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.89 
 
 		 560 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.31 
 
 		 598 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  40.34 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  38.25 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.1 
 
 		 584 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  38.83 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  39.62 
 
 		 591 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  39.03 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  39.62 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  38.25 
 
 		 578 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  36.52 
 
 		 581 aa  375  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  38.14 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.48 
 
 		 595 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  39.74 
 
 		 602 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  39.55 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  38.3 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.74 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  39.92 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  37.8 
 
 		 587 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  40.53 
 
 		 593 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  37.88 
 
 		 579 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  40.64 
 
 		 593 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  39.27 
 
 		 614 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  39.04 
 
 		 588 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  39.77 
 
 		 579 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  38.65 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  38.4 
 
 		 569 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  37.76 
 
 		 589 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  37.13 
 
 		 574 aa  359  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.68 
 
 		 582 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  39.85 
 
 		 572 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  36.5 
 
 		 643 aa  355  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.02 
 
 		 585 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 587 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.91 
 
 		 573 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  39.47 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  36.24 
 
 		 573 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  39.32 
 
 		 574 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  39.61 
 
 		 619 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  35.53 
 
 		 583 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  38.07 
 
 		 580 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  37.24 
 
 		 580 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 600 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  35.51 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  35.91 
 
 		 573 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 		 582 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  39.53 
 
 		 593 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.65 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3974  type I secretion system ATPase  35.33 
 
 		 572 aa  339  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  40.27 
 
 		 603 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  35.74 
 
 		 668 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  35.51 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  35.81 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  38.37 
 
 		 575 aa  336  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  34.76 
 
 		 570 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  36.29 
 
 		 663 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  39.77 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  36.31 
 
 		 583 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  38.27 
 
 		 587 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  37.4 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  37.2 
 
 		 578 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.36 
 
 		 671 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  37.52 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 592 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  36.47 
 
 		 578 aa  330  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  37.4 
 
 		 575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  35.63 
 
 		 591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  37.33 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  36.88 
 
 		 588 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  36.97 
 
 		 561 aa  325  9e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.1 
 
 		 667 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  41.09 
 
 		 595 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.62 
 
 		 563 aa  320  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  36.66 
 
 		 742 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  35.12 
 
 		 571 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  35.34 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  37.24 
 
 		 589 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  37.4 
 
 		 588 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.33 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.36 
 
 		 587 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.67 
 
 		 587 aa  317  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  36.13 
 
 		 764 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  36.86 
 
 		 582 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  36.36 
 
 		 588 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  41.09 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0276  type I secretion system ATPase  33.66 
 
 		 571 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  35.62 
 
 		 582 aa  313  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  36.14 
 
 		 782 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  35.31 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>