More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001272 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  100 
 
 
318 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  92.77 
 
 
318 aa  613  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  77.99 
 
 
318 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  76.42 
 
 
318 aa  506  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  66.77 
 
 
318 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  66.67 
 
 
318 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  66.07 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  65.92 
 
 
331 aa  435  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  66.24 
 
 
331 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  66.14 
 
 
318 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  63.52 
 
 
326 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  63.84 
 
 
326 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  62.46 
 
 
319 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  65.19 
 
 
318 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  63.21 
 
 
319 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  63.09 
 
 
319 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  63.21 
 
 
319 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  62.46 
 
 
319 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  62.89 
 
 
319 aa  427  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  63.38 
 
 
321 aa  427  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  62.78 
 
 
319 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  63.84 
 
 
319 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  64.24 
 
 
318 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  65.51 
 
 
335 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  64.87 
 
 
318 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  65.62 
 
 
318 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  63.41 
 
 
319 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  64.56 
 
 
318 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.56 
 
 
318 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  65.3 
 
 
318 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  64.67 
 
 
318 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  64.56 
 
 
318 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  64.56 
 
 
318 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  64.22 
 
 
316 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  64.24 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  64.24 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  64.24 
 
 
318 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  61.2 
 
 
347 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  62.89 
 
 
319 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  60.7 
 
 
320 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  58.79 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.05 
 
 
356 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  56.56 
 
 
339 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  52.83 
 
 
320 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  59.03 
 
 
324 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  55.25 
 
 
332 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  54.8 
 
 
326 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.05 
 
 
325 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  55.59 
 
 
325 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  55.25 
 
 
323 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  53.02 
 
 
321 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  54.17 
 
 
325 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  51.58 
 
 
324 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  53.33 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  52.23 
 
 
329 aa  338  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  54.4 
 
 
319 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  53.72 
 
 
327 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  52.4 
 
 
333 aa  331  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  52.4 
 
 
333 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  52.08 
 
 
333 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  50.32 
 
 
331 aa  317  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  52.23 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.7 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  48.17 
 
 
330 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 
317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.16 
 
 
325 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.87 
 
 
350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 
329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  49.33 
 
 
333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.3 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  50 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  48.17 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  49.66 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  46.5 
 
 
315 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  49.83 
 
 
325 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.01 
 
 
329 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.01 
 
 
329 aa  298  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 
333 aa  297  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
327 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.69 
 
 
330 aa  297  2e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 
327 aa  296  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  52.77 
 
 
318 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.33 
 
 
340 aa  294  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  48.38 
 
 
339 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.67 
 
 
328 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.45 
 
 
335 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.33 
 
 
353 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  50.65 
 
 
332 aa  291  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
356 aa  291  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  49.68 
 
 
337 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  48.05 
 
 
332 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 
329 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  49.19 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  49.16 
 
 
344 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
331 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.3 
 
 
328 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  52.12 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>