255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001181 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 123 aa  246  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  83.74 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  48.62 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  57.5 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  57.5 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  51.33 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  53.09 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.44 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  48.74 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.02 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  53.75 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  52.56 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  44.33 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  42.06 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  42.06 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  44.23 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  40.54 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  42.61 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  53.42 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  50.67 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  42.59 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  42.59 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 		 154 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  53.42 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  50.67 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  48.78 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  48.42 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  52.05 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  45.65 
 
 		 103 aa  83.6  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  46.84 
 
 		 226 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  41.67 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  44.68 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  41.05 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  39.29 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  46.25 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  52.05 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  48.24 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  47.95 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  45 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  51.39 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  50.68 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  51.39 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.71 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  49.33 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  43.9 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  43.75 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  42.68 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  46.67 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 		 174 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  48 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  52.78 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  52.78 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  47.95 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  38.24 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  46.05 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.89 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  42.17 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  39.45 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  39.45 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  46.58 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 		 159 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  42.31 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  42.31 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  42.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  42.31 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  44 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  45.21 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>