37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001173 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  917    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  32.49 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  30.69 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  30.26 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  31.46 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  28.19 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  28.19 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  28.67 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  30.84 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  29.03 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  27.99 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.34 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  23.09 
 
 		 616 aa  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 826 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  23.01 
 
 		 470 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  22.69 
 
 		 833 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  41.46 
 
 		 244 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.19 
 
 		 891 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.67 
 
 		 841 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  23.31 
 
 		 841 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  21.74 
 
 		 758 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.56 
 
 		 618 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.83 
 
 		 570 aa  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  27.47 
 
 		 824 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23 
 
 		 629 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  24.08 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  30.06 
 
 		 239 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  27.89 
 
 		 820 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 822 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  25.11 
 
 		 617 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  25.23 
 
 		 871 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  25.31 
 
 		 647 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  31.52 
 
 		 238 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>