24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001153 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001153  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  358  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06628  hypothetical protein  65.56 
 
 
151 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0705  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3974  hypothetical protein  36.96 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0674  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3679  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0695  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0661  hypothetical protein  40.82 
 
 
194 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.109092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3360  hypothetical protein  35.15 
 
 
182 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0662  hypothetical protein  35.15 
 
 
182 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0675  hypothetical protein  35.19 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0705  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1072  hypothetical protein  34.13 
 
 
203 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.837571  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0754  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2913  hypothetical protein  29.41 
 
 
207 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611181  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0370  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0444875  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1903  hypothetical protein  37.62 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153318  normal  0.201285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1368  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0390  hypothetical protein  33.61 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189667  unclonable  0.000000000389421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0219  putative lipoprotein  28.57 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00987  hypothetical protein  31.96 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004411  hypothetical protein  31.18 
 
 
113 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1340  putative lipoprotein  29.7 
 
 
119 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.6612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00782  hypothetical protein  28.3 
 
 
119 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>