79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001148 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001148  permease  100 
 
 		 289 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  72.32 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  48.04 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  45.3 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  45.55 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  44 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  44.91 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  40.4 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  44 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  41.91 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  43.93 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.13 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  42.41 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  43.51 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  43.36 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  39.15 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  40.93 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  44.28 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  39.15 
 
 		 288 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  44.6 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  42.09 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  43.96 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  41.61 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  34.93 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  36.79 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  43.51 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  36.64 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  36.49 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  38.86 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  43.1 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  40.59 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  44.94 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.05 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  40.84 
 
 		 194 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  35.38 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  44.85 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  37.12 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.43 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  37.5 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24.23 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.91 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.67 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  24.72 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.42 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.79 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.58 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  25.68 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  24.14 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  23.79 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.06 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  24.78 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.85 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  24.78 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  23.68 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  23.68 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  29.81 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  23.68 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  23.56 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.25 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  22.4 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  24.78 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  24.78 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  24.78 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  24.78 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.57 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>