More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001132 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  100 
 
 		 885 aa  1831    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  37.56 
 
 		 838 aa  567  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  36.99 
 
 		 836 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  36.39 
 
 		 814 aa  528  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 1017 aa  230  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  31.36 
 
 		 622 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.28 
 
 		 510 aa  214  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  29.23 
 
 		 1005 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.57 
 
 		 1891 aa  211  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 511 aa  207  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  31.07 
 
 		 526 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  28.95 
 
 		 610 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 614 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  29.19 
 
 		 599 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.9 
 
 		 1942 aa  195  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  29.03 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  30.71 
 
 		 739 aa  187  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.31 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.12 
 
 		 1975 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.18 
 
 		 593 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.68 
 
 		 620 aa  181  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.05 
 
 		 1855 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  28.17 
 
 		 925 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 524 aa  177  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  28.49 
 
 		 490 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 		 1021 aa  166  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  29.11 
 
 		 462 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.77 
 
 		 574 aa  166  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.49 
 
 		 2068 aa  164  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.77 
 
 		 649 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.85 
 
 		 564 aa  158  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 723 aa  158  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.57 
 
 		 623 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 528 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  27.07 
 
 		 624 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  31.91 
 
 		 484 aa  157  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  26.38 
 
 		 528 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.22 
 
 		 642 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  25.82 
 
 		 582 aa  154  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 742 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  26.85 
 
 		 533 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.42 
 
 		 588 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  30.7 
 
 		 576 aa  148  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  25.66 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.48 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.48 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 619 aa  145  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  26.55 
 
 		 762 aa  144  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 571 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.31 
 
 		 635 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  25.79 
 
 		 617 aa  144  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.89 
 
 		 610 aa  144  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 631 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.81 
 
 		 610 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  26.69 
 
 		 690 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.19 
 
 		 2638 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 		 703 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  25.98 
 
 		 619 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  26.42 
 
 		 686 aa  138  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  24.56 
 
 		 587 aa  137  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  27.4 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 589 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  25.92 
 
 		 686 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  27.74 
 
 		 572 aa  134  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 		 659 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  28.76 
 
 		 752 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  25.98 
 
 		 653 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  27.89 
 
 		 481 aa  133  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.2 
 
 		 586 aa  132  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.38 
 
 		 584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25 
 
 		 586 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  25.25 
 
 		 630 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.86 
 
 		 559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  23.81 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 620 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.35 
 
 		 583 aa  129  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 586 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 786 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 767 aa  128  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  24.45 
 
 		 622 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  24.89 
 
 		 765 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 521 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  24.28 
 
 		 586 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 586 aa  127  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.28 
 
 		 586 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  26.93 
 
 		 472 aa  127  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  27.02 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.07 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  24.07 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.07 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.07 
 
 		 586 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  23.81 
 
 		 586 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  24.68 
 
 		 774 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 623 aa  124  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  25.65 
 
 		 650 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  24.53 
 
 		 778 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 655 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  24.31 
 
 		 481 aa  121  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>