111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001124 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  71.13 
 
 
485 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  70.9 
 
 
487 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  63.75 
 
 
491 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  100 
 
 
487 aa  1015    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.3 
 
 
491 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.3 
 
 
491 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.11 
 
 
481 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.82 
 
 
481 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.83 
 
 
473 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.61 
 
 
481 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.47 
 
 
491 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.84 
 
 
481 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.58 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.33 
 
 
481 aa  392  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.54 
 
 
471 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.88 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.44 
 
 
486 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  48.26 
 
 
197 aa  194  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  46.67 
 
 
455 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  46.67 
 
 
455 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.67 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  52.08 
 
 
221 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  52.08 
 
 
221 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  52.08 
 
 
221 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  52.08 
 
 
221 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  45.78 
 
 
455 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  51.56 
 
 
221 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  46.22 
 
 
455 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  51.56 
 
 
221 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  46.22 
 
 
455 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  51.56 
 
 
221 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  51.04 
 
 
221 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45.78 
 
 
455 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  45.78 
 
 
455 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45.78 
 
 
455 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  45.78 
 
 
455 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  51.04 
 
 
221 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  51.04 
 
 
221 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  48.77 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  46.36 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  43.93 
 
 
459 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  51.61 
 
 
216 aa  183  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  48.28 
 
 
456 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  47.72 
 
 
458 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  45.13 
 
 
201 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  47.37 
 
 
458 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  45.93 
 
 
445 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  40.8 
 
 
201 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.34 
 
 
197 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  38.69 
 
 
236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  28.79 
 
 
391 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28.4 
 
 
390 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  37.99 
 
 
465 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  31.12 
 
 
464 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  41.04 
 
 
192 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  41.22 
 
 
233 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  41.22 
 
 
233 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  41.22 
 
 
214 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  41.22 
 
 
214 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  41.84 
 
 
185 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  41.22 
 
 
214 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  41.22 
 
 
214 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  41.13 
 
 
214 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
356 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
244 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  33.01 
 
 
266 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  33.01 
 
 
266 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  32.52 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  32.52 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  36.03 
 
 
211 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  32.09 
 
 
245 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  31.46 
 
 
262 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  31.19 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  31.52 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  31.69 
 
 
251 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  32.43 
 
 
172 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  25.97 
 
 
729 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  25.97 
 
 
729 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  32.63 
 
 
651 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  44.58 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  30.09 
 
 
436 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  30.64 
 
 
307 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  27.55 
 
 
313 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  29.85 
 
 
249 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  32.87 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  24.39 
 
 
247 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  31.58 
 
 
285 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  23.1 
 
 
534 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  23.1 
 
 
534 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  23.1 
 
 
534 aa  60.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  31.68 
 
 
211 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  30.77 
 
 
699 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.85 
 
 
393 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  30.77 
 
 
372 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 
727 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  46.43 
 
 
565 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  28.64 
 
 
359 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  40.68 
 
 
972 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>