84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000968 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000968  sodium/glutamate symporter  100 
 
 
361 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07017  hypothetical protein  97.23 
 
 
420 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07004  hypothetical protein  84.12 
 
 
417 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000964  sodium/glutamate symporter  80.56 
 
 
408 aa  608  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.187707  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0092  sodium/glutamate symporter  85.32 
 
 
408 aa  585  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000111115  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0673  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  78.33 
 
 
407 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0674  sodium/glutamate symport carrier protein (glutamate permease)  77.5 
 
 
407 aa  574  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00660523  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0103  sodium/glutamate symporter  70.08 
 
 
407 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.406513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4386  sodium/glutamate symporter  69.81 
 
 
407 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2923  sodium/glutamate symporter  68.33 
 
 
407 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4778  sodium/glutamate symporter  68.98 
 
 
407 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0118  sodium/glutamate symporter  70.28 
 
 
407 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2389  sodium/glutamate symporter  67.78 
 
 
407 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.657227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3251  sodium/glutamate symporter  67.04 
 
 
407 aa  496  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1541  sodium/glutamate symporter  69.1 
 
 
407 aa  484  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1482  sodium/glutamate symporter  68.82 
 
 
407 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.485218  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2684  sodium/glutamate symporter  69.38 
 
 
407 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2705  sodium/glutamate symporter  69.38 
 
 
407 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1682  sodium/glutamate symporter  69.38 
 
 
407 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00781316  normal  0.0287357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2781  sodium/glutamate symporter  69.38 
 
 
407 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.689609  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4777  sodium/glutamate symporter  66.76 
 
 
407 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1547  sodium/glutamate symporter  68.54 
 
 
407 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2697  sodium/glutamate symporter  48.6 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4181  sodium/glutamate symporter  48.42 
 
 
404 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0036  sodium/glutamate symporter  48.14 
 
 
404 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0040  sodium/glutamate symport carrier protein  48.14 
 
 
404 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0058  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4228  sodium/glutamate symporter  50.14 
 
 
401 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0724268  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4104  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03463  hypothetical protein  49 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0052  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03511  glutamate transporter  49 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5026  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3864  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4157  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3988  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0534  sodium/glutamate symporter  44.35 
 
 
404 aa  305  7e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0996  sodium/glutamate symporter  49.29 
 
 
401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1033  sodium/glutamate symporter  49.29 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4872  sodium/glutamate symporter  49 
 
 
403 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854487  normal  0.0119787 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0197  sodium/glutamate symporter (glutamate permease)  46.61 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000567531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4132  sodium/glutamate symporter  50.14 
 
 
401 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0214352  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3953  sodium/glutamate symporter  50.14 
 
 
401 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4026  sodium/glutamate symporter  50.14 
 
 
401 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3963  sodium/glutamate symporter  49.86 
 
 
401 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4072  sodium/glutamate symporter  49.86 
 
 
401 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0995  sodium/glutamate symporter  47.28 
 
 
401 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2080  sodium/glutamate symporter  42.82 
 
 
424 aa  295  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2020  sodium/glutamate symporter  46.89 
 
 
412 aa  293  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.733127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0319  sodium/glutamate symporter  43.06 
 
 
424 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5033  sodium/glutamate symporter  45.13 
 
 
409 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130355  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4718  sodium/glutamate symporter  44.29 
 
 
401 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1375  sodium/glutamate symporter  41.13 
 
 
428 aa  276  3e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2284  sodium/glutamate symporter  43.85 
 
 
404 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0465087  normal  0.066844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1590  sodium/glutamate symporter  43.85 
 
 
404 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0916  sodium/glutamate symport carrier protein  44.7 
 
 
402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.920005  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0496  sodium/glutamate symporter  39.49 
 
 
392 aa  253  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1028  sodium/glutamate symporter  36.68 
 
 
400 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.697633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1935  sodium:glutamate symporter  38.2 
 
 
402 aa  233  5e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2643  sodium/glutamate symporter  38.98 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0361  transporter, putative  37.5 
 
 
457 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000537763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2369  sodium/glutamate symporter  39.88 
 
 
402 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2415  sodium/glutamate symporter  39.88 
 
 
402 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2948  sodium/glutamate symporter  33.98 
 
 
409 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1355  sodium-glutamate symporter  33.61 
 
 
409 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1451  sodium/glutamate symporter  33.33 
 
 
414 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0831  sodium/glutamate symporter  35.34 
 
 
402 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1261  sodium/glutamate symporter  33.05 
 
 
402 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1050  sodium/glutamate symporter  34.83 
 
 
398 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0733546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2504  sodium/glutamate symporter  34.6 
 
 
398 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4118  hypothetical protein  32.09 
 
 
401 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.601595  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0244  sodium/glutamate symporter  32.77 
 
 
392 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17221  hypothetical protein  32.03 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1953  sodium/glutamate symporter  36.44 
 
 
404 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00992782  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4810  sodium/glutamate symporter  33.24 
 
 
399 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3454  sodium/glutamate symporter  31.3 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890755  normal  0.830149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23160  sodium/glutamate symporter  35.8 
 
 
404 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000099413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2908  sodium/glutamate symporter  25 
 
 
470 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200333  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1728  sodium/glutamate symporter  23.79 
 
 
471 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1785  sodium/glutamate symporter  24.5 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1560  sodium/glutamate symporter  26.25 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000409416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0232  sodium/glutamate symporter  22.22 
 
 
489 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.413045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2269  sodium/glutamate symporter  25 
 
 
479 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2615  sodium/glutamate symporter  25.91 
 
 
494 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00493587  normal  0.013038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>