216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000882 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  100 
 
 
378 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  84.53 
 
 
377 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  72.39 
 
 
377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  59.47 
 
 
378 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  59.47 
 
 
378 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  59.2 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  57.03 
 
 
379 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  58.29 
 
 
382 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  56.8 
 
 
379 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  56.8 
 
 
379 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  56.2 
 
 
381 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  56.8 
 
 
379 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  56.53 
 
 
379 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  57.07 
 
 
384 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  55.11 
 
 
380 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  54.97 
 
 
384 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  59.21 
 
 
384 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  53.21 
 
 
386 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  51.92 
 
 
394 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  53.44 
 
 
392 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  53.87 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  52.8 
 
 
382 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  53.87 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  56.35 
 
 
380 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  52.8 
 
 
382 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  52.8 
 
 
382 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  53.87 
 
 
381 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  53.6 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  52.8 
 
 
382 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  53.87 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  53.87 
 
 
381 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  53.87 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  53.87 
 
 
381 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  55.14 
 
 
388 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  56.95 
 
 
381 aa  362  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  52.34 
 
 
389 aa  362  8e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  53.7 
 
 
381 aa  362  8e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  53.7 
 
 
381 aa  362  9e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  54.11 
 
 
379 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  51.34 
 
 
373 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  51.07 
 
 
384 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  53.78 
 
 
380 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  51.34 
 
 
373 aa  358  9e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  53.78 
 
 
380 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  53.78 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  53.51 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  55.14 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  53.51 
 
 
380 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  49.21 
 
 
381 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  53.07 
 
 
381 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  51.06 
 
 
381 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  52.25 
 
 
379 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  53.7 
 
 
381 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  51.46 
 
 
381 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  53.6 
 
 
388 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  53.6 
 
 
388 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  53.6 
 
 
388 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  53.02 
 
 
384 aa  349  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  52.8 
 
 
394 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  50.93 
 
 
385 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  50.93 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  51.04 
 
 
394 aa  345  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  52.53 
 
 
381 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  50.93 
 
 
381 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  50.66 
 
 
385 aa  345  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  52.97 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  52.97 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  52.53 
 
 
381 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  52.53 
 
 
381 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  52.53 
 
 
381 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  52 
 
 
381 aa  343  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  52 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  52 
 
 
381 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  53.78 
 
 
387 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  48.41 
 
 
380 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  51.59 
 
 
395 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  51.47 
 
 
381 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  50.93 
 
 
379 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  50.53 
 
 
381 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  50.79 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  51.73 
 
 
381 aa  339  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  48.62 
 
 
402 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  48.75 
 
 
403 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  52.27 
 
 
380 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  49.12 
 
 
402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  52.27 
 
 
380 aa  338  8e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  52.76 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  51.33 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  49.47 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  53.07 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  47.07 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  46.81 
 
 
381 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  49.12 
 
 
403 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  50.53 
 
 
381 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  52.7 
 
 
380 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  52.53 
 
 
381 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  54.86 
 
 
379 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  54.4 
 
 
389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  51.35 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  47.04 
 
 
380 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>