129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000827 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  84.23 
 
 		 249 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  59.83 
 
 		 251 aa  292  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  57.26 
 
 		 272 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  51.71 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  45.41 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  44.26 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  45.41 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  44.5 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  28 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  24.02 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  24.76 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  23.65 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  21.66 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  24.22 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  24.04 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 316 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  23.62 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  23.62 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.68 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  23.9 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  23.79 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.23 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  23.83 
 
 		 317 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  23.72 
 
 		 295 aa  48.9  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  24.5 
 
 		 306 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  23.83 
 
 		 317 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  25.13 
 
 		 301 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 		 275 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.31 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  27.22 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  22.58 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  24.39 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  27.78 
 
 		 364 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  27.22 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.05 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  23.78 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  25 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.54 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  24.17 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  24.87 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  28.46 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>