More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000793 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  86.05 
 
 		 380 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 380 aa  781    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  71.86 
 
 		 381 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  68.31 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  53.12 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  49.86 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.3 
 
 		 416 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.81 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  48.35 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.99 
 
 		 321 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  49.56 
 
 		 323 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  48.71 
 
 		 320 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 		 321 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.12 
 
 		 321 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  51.03 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.83 
 
 		 321 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.12 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.83 
 
 		 321 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  47.54 
 
 		 321 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.54 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  47.25 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  44.71 
 
 		 735 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  44.16 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  43.47 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  42.75 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.61 
 
 		 590 aa  265  8e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.39 
 
 		 611 aa  262  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  38.42 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.54 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  37.08 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  36.75 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  37.43 
 
 		 329 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  36.39 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  35.71 
 
 		 337 aa  226  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.46 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  36.71 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  63.23 
 
 		 181 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  38.05 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 155 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  68.09 
 
 		 187 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  36.45 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  64.63 
 
 		 158 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  69.5 
 
 		 167 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  69.5 
 
 		 167 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  65.22 
 
 		 141 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  62.07 
 
 		 290 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  61.64 
 
 		 202 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  58.11 
 
 		 148 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  63.38 
 
 		 191 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 183 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 		 198 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 		 174 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  56.08 
 
 		 212 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  51.76 
 
 		 175 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  48.88 
 
 		 212 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  34.93 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  58.39 
 
 		 152 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  45.37 
 
 		 211 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 211 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 		 242 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  47.34 
 
 		 212 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 214 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 		 177 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  57.24 
 
 		 184 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 		 177 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 		 174 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 		 260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  45.9 
 
 		 223 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  62.88 
 
 		 157 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  62.69 
 
 		 153 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 		 178 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  48.28 
 
 		 191 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  48.28 
 
 		 191 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  47.9 
 
 		 178 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  42.71 
 
 		 208 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 178 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  44.28 
 
 		 198 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 178 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 178 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 201 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  60.87 
 
 		 150 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  44.62 
 
 		 212 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 178 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 		 208 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 178 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 158 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 		 178 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  65.91 
 
 		 147 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  65.91 
 
 		 147 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 		 178 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.99 
 
 		 311 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 223 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  50.99 
 
 		 181 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  61.19 
 
 		 153 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>