239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000727 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  100 
 
 		 599 aa  1209    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  89.08 
 
 		 597 aa  1088    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  70.95 
 
 		 598 aa  858    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  51.09 
 
 		 611 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  51.33 
 
 		 602 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  50.92 
 
 		 611 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  51.51 
 
 		 608 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  50.84 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  50.34 
 
 		 601 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  46.31 
 
 		 622 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  45.27 
 
 		 607 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  48.05 
 
 		 637 aa  525  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  43.87 
 
 		 760 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  45.24 
 
 		 599 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  47.15 
 
 		 670 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  47.15 
 
 		 673 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  48.5 
 
 		 670 aa  515  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.32 
 
 		 669 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  46.48 
 
 		 666 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  47.37 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  45.08 
 
 		 764 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  43.65 
 
 		 619 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  47.8 
 
 		 660 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  46.14 
 
 		 719 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  47.8 
 
 		 660 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  47.62 
 
 		 660 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  45.08 
 
 		 763 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  43.97 
 
 		 651 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  46.98 
 
 		 616 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  47.62 
 
 		 660 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  46.88 
 
 		 643 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  45.75 
 
 		 602 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  47.49 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  44.82 
 
 		 616 aa  475  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 617 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 		 852 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 		 604 aa  352  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  37.63 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  34.47 
 
 		 623 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 596 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 596 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  35.55 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 596 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.55 
 
 		 596 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  33.33 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  30.68 
 
 		 640 aa  279  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  36.26 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 652 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 652 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 607 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  33.22 
 
 		 629 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 640 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 641 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  30.91 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 		 584 aa  249  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 628 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.88 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 		 639 aa  229  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  31.49 
 
 		 617 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  33.47 
 
 		 637 aa  228  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  33.89 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  38.95 
 
 		 593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 		 617 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  34.62 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.84 
 
 		 612 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 		 407 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.37 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  28.88 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 628 aa  170  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.4 
 
 		 399 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 		 399 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  33.43 
 
 		 421 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.66 
 
 		 414 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.66 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.66 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.29 
 
 		 421 aa  135  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  31.75 
 
 		 505 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.34 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  30.15 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.62 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 598 aa  97.4  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.98 
 
 		 596 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.51 
 
 		 496 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.53 
 
 		 616 aa  91.3  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  23.37 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  24.87 
 
 		 484 aa  90.1  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.43 
 
 		 580 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  26.39 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  27.96 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  23.99 
 
 		 577 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  27.71 
 
 		 624 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>