More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000723 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000723  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  100 
 
 		 96 aa  186  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851258  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0415  co-chaperonin GroES  87.5 
 
 		 96 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3530  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.437614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3404  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0592  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04012  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3850  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4611  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325354 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4697  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4383  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03974  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3870  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.819569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5658  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4671  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0727  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.816729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0508  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0981396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3823  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3676  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0723  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2238  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0329  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  126  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0408  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4599  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4726  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4690  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4607  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4747  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.739069  normal  0.604032 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0467  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  62.5 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4309  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0471  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.695304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3690  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  120  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0641  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.409973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0421  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0703  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3568  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00627875  decreased coverage  0.00976024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3398  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249246  decreased coverage  0.000697268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0554  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.109062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3661  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000131471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0671  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0644  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0667  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3709  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.771155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0700  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000383643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3125  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0218784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  60.42 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2494  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  60.42 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0174114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0018  10 kDa chaperonin 1  59.38 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  48.96 
 
 		 97 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  47.92 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  100  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2159  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 97 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 97 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  47.92 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>