More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000499 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  100 
 
 		 330 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  85.35 
 
 		 334 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  59.39 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  58.95 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.17 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.12 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.91 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.59 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  31.06 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  34.83 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  32.63 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.29 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  29.27 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  29.27 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  29.27 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  28.53 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.53 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  28.53 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  28.53 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  28.53 
 
 		 354 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  28.53 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  27.2 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  28.96 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  28.69 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  28.61 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  27.08 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  28.61 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  26.59 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  27.76 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  27.4 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  28.32 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  28.03 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  27.38 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  28.03 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  28.12 
 
 		 351 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  26.42 
 
 		 367 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  25.57 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  27.82 
 
 		 355 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  26.49 
 
 		 366 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  27.75 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.62 
 
 		 468 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45.08 
 
 		 239 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.3 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  47.5 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  47.5 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  51.46 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.03 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  25.98 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 		 222 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.61 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  25.7 
 
 		 372 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  53.4 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  53.4 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  27.53 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  52.43 
 
 		 230 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  51.46 
 
 		 210 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  51.46 
 
 		 210 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  49.51 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  25.66 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  48.51 
 
 		 459 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  25.56 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  48.57 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  25.66 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  48.54 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 239 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  25.07 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  49.52 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  48.57 
 
 		 217 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  45 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  25.94 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  24.43 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  51.49 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  45 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.49 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  50.49 
 
 		 230 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.6 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  47.62 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  45 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>