20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000456 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  100 
 
 
3470 aa  7061    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  54.23 
 
 
3146 aa  3153    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
4678 aa  83.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  24.81 
 
 
4689 aa  77  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  22.56 
 
 
4830 aa  67.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  22.83 
 
 
3864 aa  66.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  65.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  23.32 
 
 
7434 aa  63.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  24.07 
 
 
1196 aa  57.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  24.3 
 
 
2768 aa  55.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  24.59 
 
 
918 aa  52  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  22.81 
 
 
2270 aa  52  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  25.19 
 
 
5442 aa  50.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  24.7 
 
 
790 aa  49.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  26.65 
 
 
1461 aa  48.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  28.38 
 
 
570 aa  48.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  23.7 
 
 
873 aa  47.8  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  23 
 
 
954 aa  47.8  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.8 
 
 
2156 aa  47.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  23.83 
 
 
781 aa  46.6  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>