More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000372 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
258 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  70.73 
 
 
263 aa  363  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  69.51 
 
 
261 aa  357  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  70.73 
 
 
262 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  70.63 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  67.59 
 
 
260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  71.14 
 
 
257 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  72.59 
 
 
260 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  66.93 
 
 
260 aa  352  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1341  enoyl-CoA hydratase  69.11 
 
 
260 aa  351  8e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
265 aa  348  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  65.89 
 
 
259 aa  346  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  68.95 
 
 
257 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  71.43 
 
 
257 aa  343  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  69.05 
 
 
257 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  69.05 
 
 
257 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  69.05 
 
 
257 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  69.05 
 
 
257 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  71.83 
 
 
257 aa  343  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0221  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
265 aa  338  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.919507  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  66.14 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  69.76 
 
 
257 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  66.41 
 
 
262 aa  328  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  69.35 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  69.35 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  68.65 
 
 
257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
272 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  63.81 
 
 
272 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0657  enoyl-CoA hydratase  58.53 
 
 
258 aa  315  6e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  61.87 
 
 
303 aa  312  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
256 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  57.49 
 
 
263 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  57.49 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  54.55 
 
 
268 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 
262 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 
268 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_003296  RS05574  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 
266 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.116145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0922  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
264 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2182  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
264 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0830  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
264 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3977  enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4090  enoyl-CoA hydratase  56.68 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1799  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
264 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5327  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
263 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0280176  normal  0.0376656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3408  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
263 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4959  enoyl-CoA hydratase  58.61 
 
 
263 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 
259 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
263 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 
260 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
257 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
263 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
263 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
260 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
267 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
260 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
257 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.37 
 
 
255 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.76 
 
 
255 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
255 aa  168  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.37 
 
 
255 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
257 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
258 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.18 
 
 
258 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
257 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  39.68 
 
 
663 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
258 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
260 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
258 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
260 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
259 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 
258 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
258 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.4 
 
 
257 aa  158  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
258 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
260 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
259 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>