More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000328 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  100 
 
 
128 aa  266  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  91.41 
 
 
128 aa  248  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
139 aa  154  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
138 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
138 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
138 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
138 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  49.61 
 
 
138 aa  141  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
133 aa  140  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  48.41 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  49.61 
 
 
132 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  48.41 
 
 
139 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  47.24 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 
134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  48.41 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  46.83 
 
 
144 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 
137 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
147 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 
134 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.28 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  42.52 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
136 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
135 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
171 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
139 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 
142 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
128 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
129 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
129 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
129 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  39.37 
 
 
129 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
149 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 
135 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
136 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
136 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
132 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
137 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
136 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
129 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
166 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 
138 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
182 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  37.5 
 
 
131 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
136 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 
154 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
133 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  41.73 
 
 
169 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 
129 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.22 
 
 
144 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  40.62 
 
 
130 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 
138 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.01 
 
 
134 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
142 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.68 
 
 
132 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 
154 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
143 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
163 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  38.58 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
157 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
159 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.9 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
129 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  38.58 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1385  transcriptional regulator of MerR family protein  39.67 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>