More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000189 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  100 
 
 
578 aa  1206    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  64.55 
 
 
580 aa  750    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  84.6 
 
 
585 aa  1041    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  46.86 
 
 
579 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  42.5 
 
 
583 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  41.61 
 
 
583 aa  445  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  41.62 
 
 
592 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  42.34 
 
 
578 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  42.14 
 
 
583 aa  445  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  42.73 
 
 
586 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  42.93 
 
 
573 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  40.64 
 
 
577 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  41.16 
 
 
580 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.87 
 
 
581 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.61 
 
 
581 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.43 
 
 
581 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  41.12 
 
 
580 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  41.26 
 
 
581 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  40.71 
 
 
581 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  30.09 
 
 
664 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.28 
 
 
591 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.95 
 
 
607 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.56 
 
 
558 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.39 
 
 
581 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.6 
 
 
601 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.14 
 
 
533 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.79 
 
 
523 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.32 
 
 
555 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.79 
 
 
584 aa  203  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.57 
 
 
526 aa  203  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.41 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  28.64 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 
627 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 
529 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.42 
 
 
663 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.4 
 
 
607 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.45 
 
 
605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  27.1 
 
 
637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  26.94 
 
 
637 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.99 
 
 
520 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.93 
 
 
532 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
657 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.23 
 
 
659 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.29 
 
 
672 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.45 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  25.26 
 
 
641 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.37 
 
 
587 aa  163  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  25.27 
 
 
663 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.22 
 
 
504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.31 
 
 
582 aa  147  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  26.8 
 
 
619 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.33 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.19 
 
 
517 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26 
 
 
515 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.78 
 
 
518 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.77 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  22.6 
 
 
518 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  22.6 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  21.59 
 
 
530 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  22.42 
 
 
518 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
313 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22 
 
 
518 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.09 
 
 
509 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.68 
 
 
503 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24 
 
 
1202 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.91 
 
 
1181 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24 
 
 
1215 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  23.83 
 
 
520 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.83 
 
 
523 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.14 
 
 
517 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.83 
 
 
520 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.83 
 
 
523 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.91 
 
 
549 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.53 
 
 
549 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  26.11 
 
 
577 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.98 
 
 
1175 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  28.51 
 
 
515 aa  97.1  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28.15 
 
 
302 aa  97.1  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.75 
 
 
516 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  24.48 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  22.31 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.51 
 
 
539 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.08 
 
 
508 aa  94.4  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.08 
 
 
508 aa  94.4  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
303 aa  93.6  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  27.01 
 
 
313 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.88 
 
 
1284 aa  90.9  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.07 
 
 
479 aa  90.5  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
315 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.72 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  31.69 
 
 
565 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0542  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.62 
 
 
550 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103299  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1027  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.4 
 
 
550 aa  87.4  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  27.78 
 
 
481 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  20.76 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.08 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  21.08 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  21.52 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  20.58 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>