More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000110 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  597  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05716  hypothetical protein  84 
 
 		 176 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00274  transcriptional regulator, AraC family protein  28.52 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3601  response regulator receiver domain-containing protein  30.55 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05718  hypothetical protein  92.31 
 
 		 57 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2328  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  24.19 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  25.93 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  25.93 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 327 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  24.71 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1694  transcriptional regulator, AraC family  23.22 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  21.76 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2287  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000984991  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  22.18 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  26.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2271  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.05 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  24.49 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.82 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000320877  normal  0.335599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  21.67 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  22.42 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  21.16 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.51 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1546  AraC family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000827637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.59 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  20.08 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0066  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  23.51 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.59 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  20.08 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.19 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>