More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000101 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  100 
 
 		 102 aa  211  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  67.01 
 
 		 105 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  67.39 
 
 		 97 aa  129  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  55.32 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  51.55 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  49.48 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  50.52 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  49.48 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  47.96 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  43.18 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  43.75 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  46.88 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  47.92 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  46.39 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40.62 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.39 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  44.79 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  45.36 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.36 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  36.73 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  34.65 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  48.15 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  41.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  38.54 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  46.08 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  41.41 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  42.53 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>