21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000096 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000096  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.482372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4776  hypothetical protein  61.81 
 
 		 156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0192522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0392  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  59.03 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05161  hypothetical protein  55.56 
 
 		 163 aa  169  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1958  hypothetical protein  51.8 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0107464  normal  0.0222962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2454  hypothetical protein  40.71 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4340  hypothetical protein  42.45 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0031  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3776  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4124  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0592  hypothetical protein  46.27 
 
 		 159 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1738  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1231  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1649  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1071  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0355  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0064  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.64841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0229  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1180  hypothetical protein  40.3 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0102  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5513  secreted protein  23.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.390859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>