More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000083 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  89.58 
 
 		 162 aa  275  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  81.25 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1845  thioredoxin 2  69.44 
 
 		 144 aa  206  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.227505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  56.25 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  60.58 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  56.83 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  56.83 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  56.83 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  56.83 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  56.83 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  51.77 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  51.77 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  51.77 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  56.12 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  55.32 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  53.9 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  57.89 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  57.46 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  59.4 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  59.4 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  57.14 
 
 		 178 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  58.65 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  57.58 
 
 		 170 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  57.58 
 
 		 170 aa  153  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  56.06 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  57.58 
 
 		 170 aa  153  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  50 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  56.82 
 
 		 170 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  49.3 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  47.37 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  46.21 
 
 		 144 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  47.14 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  43.18 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  49.28 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  45.86 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  47.1 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  42.42 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  42.42 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  43.18 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  42.25 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  46.43 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  44.53 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  45.26 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  41.67 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  43.97 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  44.2 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  45.8 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  41.54 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  40.15 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  40 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  40 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  42.03 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  43.18 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  38.46 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  44.53 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  41.43 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  44.44 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  43.94 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  40.14 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  38.46 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  43.75 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  41.3 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  41.3 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  44.6 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3451  thioredoxin  45.65 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.560369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  39.86 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  38.41 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  38.46 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  39.01 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  40 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  38.97 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.06 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  40.91 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.09 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  41.01 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  34.97 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  38.64 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0306  thioredoxin  38.46 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00417001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  39.39 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  47.87 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.91 
 
 		 107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  38.03 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  37.76 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  49.02 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  36.62 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  38.24 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>