More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000078 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  45.92 
 
 		 764 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  69.76 
 
 		 723 aa  1052    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  100 
 
 		 723 aa  1465    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  46.06 
 
 		 742 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  45.06 
 
 		 732 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 746 aa  595  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  44.25 
 
 		 733 aa  595  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  44.13 
 
 		 726 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  44.13 
 
 		 726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  43.56 
 
 		 732 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  44.13 
 
 		 726 aa  582  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 745 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  42.58 
 
 		 745 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  42.72 
 
 		 745 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  40.31 
 
 		 808 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  40.17 
 
 		 817 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  40.17 
 
 		 808 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  38.09 
 
 		 698 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 751 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 758 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  29.83 
 
 		 755 aa  263  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.45 
 
 		 816 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.25 
 
 		 813 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 849 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 738 aa  220  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 843 aa  217  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  27.29 
 
 		 812 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.25 
 
 		 709 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 717 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.47 
 
 		 704 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 710 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 721 aa  181  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 700 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 723 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 725 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 701 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 725 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 725 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 723 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 725 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 716 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  26.79 
 
 		 713 aa  171  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 704 aa  170  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  27.32 
 
 		 721 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 723 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 724 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 809 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  23.71 
 
 		 713 aa  150  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 783 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  24.58 
 
 		 771 aa  140  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 716 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  33.78 
 
 		 714 aa  125  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  29.06 
 
 		 332 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 817 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 728 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 739 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.3 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.98 
 
 		 755 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.01 
 
 		 661 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.62 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  23.71 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 681 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.78 
 
 		 645 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.71 
 
 		 659 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.71 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.31 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.31 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.31 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.31 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.31 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  26.99 
 
 		 675 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  34.09 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  34.48 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 701 aa  67.4  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.14 
 
 		 656 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 722 aa  67  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 736 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.32 
 
 		 647 aa  65.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  27.44 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 628 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  21.21 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 686 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>