More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000072 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000072  uroporphyrinogen-III methyltransferase  100 
 
 		 252 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  76.76 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  60.74 
 
 		 473 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  60.74 
 
 		 473 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  60.74 
 
 		 470 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  60.83 
 
 		 457 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  60.83 
 
 		 467 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  60 
 
 		 457 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  59.09 
 
 		 457 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  59.92 
 
 		 459 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  59.58 
 
 		 457 aa  298  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  59.58 
 
 		 457 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  59.58 
 
 		 457 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  59.58 
 
 		 459 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  58.26 
 
 		 459 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.67 
 
 		 480 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.8 
 
 		 283 aa  282  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.08 
 
 		 480 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.14 
 
 		 479 aa  278  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.85 
 
 		 464 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.51 
 
 		 482 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  55.06 
 
 		 465 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.33 
 
 		 479 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  54.66 
 
 		 465 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.02 
 
 		 482 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.2 
 
 		 464 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.58 
 
 		 472 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  56.56 
 
 		 464 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  56.15 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.79 
 
 		 463 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.96 
 
 		 463 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.96 
 
 		 463 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  54.69 
 
 		 458 aa  270  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  53.91 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.79 
 
 		 464 aa  268  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  54.55 
 
 		 462 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  52 
 
 		 493 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.96 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001708  uroporphyrinogen-III methyltransferase  56.68 
 
 		 295 aa  262  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2314  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.32 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.88 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3717  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.38 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  55.6 
 
 		 472 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.32 
 
 		 473 aa  261  8e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.32 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.67 
 
 		 502 aa  259  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.09 
 
 		 473 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.72 
 
 		 277 aa  258  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00765  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.47 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.67 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.09 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.13 
 
 		 269 aa  254  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.02 
 
 		 462 aa  255  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  53.06 
 
 		 474 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.67 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  52.67 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0662  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.89 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4228  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.69 
 
 		 292 aa  252  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.83 
 
 		 472 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  55.83 
 
 		 472 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  55.83 
 
 		 472 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  52.26 
 
 		 462 aa  251  8.000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.82 
 
 		 511 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.26 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.39 
 
 		 481 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06660  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  52.74 
 
 		 279 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.82 
 
 		 510 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.62 
 
 		 484 aa  248  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3275  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.85 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49 
 
 		 504 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.2 
 
 		 513 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 		 470 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0611  putative uroporphyrin-III c-methyltransferase  50.81 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.2 
 
 		 504 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  49.79 
 
 		 468 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.44 
 
 		 272 aa  245  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05583  siroheme synthase  53.94 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.24 
 
 		 273 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.81 
 
 		 504 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2138  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.06 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001603  uroporphyrinogen-III methyltransferase  54.36 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.28 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.57 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.16 
 
 		 258 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.26 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  50.4 
 
 		 401 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>