233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000071 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  100 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  76.98 
 
 		 270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  52.94 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  51.27 
 
 		 282 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  49.63 
 
 		 279 aa  274  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  49.63 
 
 		 279 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  52.87 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  48.87 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  51.89 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  52.12 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  50.96 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  47.89 
 
 		 270 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  49.1 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  50.38 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  49.62 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  50.58 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  50.36 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  48.18 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  51.34 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  51.34 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  51.34 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  49.24 
 
 		 284 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  48.51 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  49.81 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  49.81 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  46.95 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  48.75 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  48.75 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  48.39 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  47.02 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  43.97 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  49.24 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  48.45 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  46.99 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  40.89 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  40.22 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  35.64 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  37.72 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  37.98 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  35.44 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  35.44 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  35.9 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  34.69 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  35.16 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  38.24 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  35.42 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  39.23 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  33.71 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  34.78 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  34.34 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  37.55 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  36.71 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.07 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  32.85 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.05 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.36 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  29.07 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  29.08 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  28.72 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.54 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  29.6 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.54 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.54 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.54 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.54 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  29.43 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  30.24 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  28.52 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  28.72 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  29.24 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  31.65 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  30.91 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  30.63 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  30.08 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.3 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  34.62 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  32.03 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.62 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  30.19 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  29.23 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  25.52 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  31.09 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  28.47 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.23 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  27.8 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  29.82 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>