152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000051 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02063  D-lactate dehydrogenase, FAD-binding, NADH independent  58.24 
 
 		 571 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1524  D-lactate dehydrogenase  58.24 
 
 		 571 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.599972  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01443  D-lactate dehydrogenase  61.09 
 
 		 567 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2401  D-lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 576 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.75215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3259  D-lactate dehydrogenase  58.06 
 
 		 571 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3071  D-lactate dehydrogenase  53.01 
 
 		 596 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00174094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000051  D-Lactate dehydrogenase  100 
 
 		 568 aa  1181    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2160  D-lactate dehydrogenase  54.22 
 
 		 579 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0784  D-lactate dehydrogenase  54.55 
 
 		 563 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0240259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2513  D-lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 576 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.730423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1563  D-lactate dehydrogenase  54.01 
 
 		 563 aa  646    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2405  D-lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 576 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2356  D-lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 576 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2312  D-lactate dehydrogenase  57.53 
 
 		 576 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01510  D-lactate dehydrogenase  54.66 
 
 		 577 aa  656    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2732  D-lactate dehydrogenase  58.63 
 
 		 588 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3636  D-lactate dehydrogenase  53.78 
 
 		 590 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02021  hypothetical protein  58.24 
 
 		 571 aa  694    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1080  D-lactate dehydrogenase  60.94 
 
 		 590 aa  749    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2805  D-lactate dehydrogenase  56.68 
 
 		 570 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05675  D-lactate dehydrogenase  88.56 
 
 		 577 aa  1068    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2268  D-lactate dehydrogenase  57.89 
 
 		 571 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2423  D-lactate dehydrogenase  58.06 
 
 		 571 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1364  D-lactate dehydrogenase  59.32 
 
 		 566 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5004  D-lactate dehydrogenase  57.4 
 
 		 571 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.915993  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1351  D-lactate dehydrogenase  57.04 
 
 		 570 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2884  D-lactate dehydrogenase  57.27 
 
 		 570 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1514  D-lactate dehydrogenase  58.24 
 
 		 571 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0911  D-lactate dehydrogenase  57.89 
 
 		 571 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.42749  normal  0.35472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3451  D-lactate dehydrogenase  56.47 
 
 		 579 aa  669    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770916  normal  0.693661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1315  D-lactate dehydrogenase  57.52 
 
 		 585 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0839  D-lactate dehydrogenase  58.06 
 
 		 571 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2057  D-lactate dehydrogenase  54.76 
 
 		 579 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2752  D-lactate dehydrogenase  53.6 
 
 		 579 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.892308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3347  D-lactate dehydrogenase  53.52 
 
 		 584 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603503 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2928  D-lactate dehydrogenase  51.89 
 
 		 569 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.366803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2359  D-lactate dehydrogenase  51.77 
 
 		 568 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32775  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C33  D-lactate dehydrogenase  49.01 
 
 		 559 aa  566  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13031  D-lactate dehydrogenase  48.82 
 
 		 566 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.122065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05140  D-lactate dehydrogenase  43.99 
 
 		 569 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46664  predicted protein  27.38 
 
 		 691 aa  200  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.82 
 
 		 474 aa  67  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.74 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  28.25 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  25.99 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  27.68 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.01 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3158  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.61 
 
 		 468 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  25.32 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  27.22 
 
 		 468 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  27.71 
 
 		 477 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  26.25 
 
 		 498 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.54 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.1 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.75 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.14 
 
 		 474 aa  53.5  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4328  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.29 
 
 		 475 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  29.94 
 
 		 461 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.95 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  27.67 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 		 475 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  29.94 
 
 		 481 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  26.38 
 
 		 463 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 480 aa  50.8  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.7 
 
 		 475 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0865  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 		 176 aa  50.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0822116  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.67 
 
 		 475 aa  50.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  24.84 
 
 		 495 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 483 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.79 
 
 		 519 aa  50.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  29.22 
 
 		 509 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.95 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  30.57 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0553  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.812155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.9 
 
 		 490 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  25.64 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  25.64 
 
 		 471 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  27.27 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.48 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 		 489 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.38 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  21.7 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.48 
 
 		 480 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>