More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000037 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  100 
 
 		 365 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  51.57 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 385 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  43.27 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  44.14 
 
 		 385 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  41.05 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 		 374 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  38.63 
 
 		 375 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  33.15 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.87 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.62 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.33 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.33 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.78 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.33 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.93 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.07 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.26 
 
 		 390 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.8 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.8 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 418 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 983 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.93 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.35 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 960 aa  94  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 492 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 984 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.44 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  25.07 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  25.46 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  23.53 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.78 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  25.7 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.85 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.85 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.71 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 446 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.78 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.56 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 385 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  26.9 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  25.57 
 
 		 666 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  27.86 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.57 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>