144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000026 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  35.33 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  31.36 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  27.07 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  29.6 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  27.48 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  28.73 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  26.28 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  24.83 
 
 		 356 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  23.15 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  24.49 
 
 		 341 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  28.14 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  22.52 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.77 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  22.37 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  23.1 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  25.08 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.38 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  25.27 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  23.58 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  25.09 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  26.17 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  26.17 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  26.17 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.62 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  26.17 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.76 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  23.46 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  24.75 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  24.65 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  23.46 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.52 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  24.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  26.38 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  25.93 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  24.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  24.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  26.38 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  24.51 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.54 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  24.02 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  25.08 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  24.2 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  23.93 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.81 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.94 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  24.63 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25.94 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  27.03 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.67 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  25.83 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  23.24 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  23.79 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.2 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  23.69 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  25.26 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  23.37 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  25.38 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  23.89 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  33.06 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  25.81 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  23.47 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  30.09 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  21.89 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  24.91 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  25.43 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  33.05 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  33.05 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  33.05 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  33.05 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  23.81 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  23.27 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  33.05 
 
 		 492 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  27.57 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  33.05 
 
 		 456 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  22.32 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  30.83 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 488 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  27.31 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  26.4 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  25.35 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  24.12 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  28.17 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  26.4 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  23.51 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  35.79 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  24.16 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  22.85 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  30.25 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  20.81 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  25.11 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>