50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000003 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  91.79 
 
 		 134 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  59.69 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  41.35 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  38.35 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  36.09 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  37.3 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  34.71 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  36.8 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  36.43 
 
 		 223 aa  84.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  32.81 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  32.09 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  32.35 
 
 		 200 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  32.8 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  32.8 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  36.9 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  30.39 
 
 		 201 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  32.63 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  29.91 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  29.84 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  26.87 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  28.23 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  33.06 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  30.39 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  25 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  28.46 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  26.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  27.16 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  25.93 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  23.68 
 
 		 150 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  23.58 
 
 		 203 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>