79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2857 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  315  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  85.06 
 
 
157 aa  270  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  81.37 
 
 
161 aa  269  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  71.43 
 
 
163 aa  241  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  62.91 
 
 
156 aa  206  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  59.6 
 
 
156 aa  200  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  62.18 
 
 
159 aa  200  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  60.26 
 
 
156 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  60.26 
 
 
156 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  57.62 
 
 
156 aa  191  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  57.62 
 
 
156 aa  189  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  56.6 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  57.86 
 
 
157 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  57.86 
 
 
157 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  57.86 
 
 
157 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  57.86 
 
 
157 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  57.86 
 
 
157 aa  187  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  56.6 
 
 
157 aa  186  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  56.6 
 
 
157 aa  186  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  56.6 
 
 
157 aa  186  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  60 
 
 
157 aa  184  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  55.35 
 
 
157 aa  184  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  56.29 
 
 
155 aa  184  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  54.72 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  55.35 
 
 
157 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  58.94 
 
 
156 aa  177  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  56.49 
 
 
155 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  55.19 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  53.9 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  53.9 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  53.9 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  53.9 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  53.9 
 
 
155 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  53.25 
 
 
156 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  54.36 
 
 
156 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  53.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  53.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  53.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  53.25 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  50.98 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  51.3 
 
 
156 aa  163  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  51.95 
 
 
155 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  49.34 
 
 
153 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  42.95 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  53.33 
 
 
108 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  53.33 
 
 
108 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  38.51 
 
 
150 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  37.41 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  36.05 
 
 
150 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  35.95 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  34.87 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  31.79 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  35.17 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  31.65 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  32.26 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  32.06 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  32.38 
 
 
426 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  32.06 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  30.87 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  32.79 
 
 
478 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  33.04 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  24.65 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  27.74 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  27.74 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  27.07 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  32.82 
 
 
637 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  28.46 
 
 
440 aa  44.7  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0767  hypothetical protein  30.43 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  24.47 
 
 
142 aa  43.9  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  26.09 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  29.6 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  26.09 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  30.3 
 
 
573 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  30.25 
 
 
464 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  26.26 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>