113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2856 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  80.08 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  78.09 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  73.91 
 
 		 259 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  55.2 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  53.01 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  51.97 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  50.99 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  51.18 
 
 		 258 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  48.74 
 
 		 277 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  48.72 
 
 		 274 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  48.74 
 
 		 277 aa  261  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  50.79 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  50.79 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  50.79 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  48.38 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  50.79 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  49.09 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  47.92 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  46.55 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  50.99 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  46.18 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  46.18 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  50.99 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  49.01 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  49.41 
 
 		 266 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  49.41 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  50.79 
 
 		 266 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  49.01 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  50.8 
 
 		 252 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  48.19 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  47.79 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  47.79 
 
 		 253 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  47.39 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  47.79 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  46.59 
 
 		 253 aa  242  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  48.18 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  47.79 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  47.79 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  47.79 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  48.18 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  47.35 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  46.18 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  46.15 
 
 		 253 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  48.99 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  49.38 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  40.15 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  40.31 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  47.46 
 
 		 239 aa  198  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  38.91 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  26.29 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  27.8 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  29.34 
 
 		 420 aa  85.9  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0380  putative integral membrane protein  26.37 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  27.38 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2818  protein of unknown function DUF1212  26.83 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  27.16 
 
 		 426 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2927  hypothetical protein  26.25 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2542  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  23.79 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  23.39 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  28.19 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  27.13 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  24.4 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  26.86 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  27.94 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  30.23 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  23.46 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  32.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  26.72 
 
 		 433 aa  65.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  23.05 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  24.59 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  25.82 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  24 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  25.41 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  21.92 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  21.92 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  21.92 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  25.5 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.1 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  22.95 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  26.77 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  24.38 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  24.89 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  22.57 
 
 		 529 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  24.37 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  23.61 
 
 		 468 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  23.19 
 
 		 509 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  22.87 
 
 		 511 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  21.37 
 
 		 455 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  21.09 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  22.53 
 
 		 510 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  21.91 
 
 		 529 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 159 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  27.56 
 
 		 555 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.79 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  24.7 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  20.59 
 
 		 466 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>