200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2848 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  100 
 
 		 328 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  85.71 
 
 		 322 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  81.17 
 
 		 324 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  84.16 
 
 		 322 aa  552  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  69.21 
 
 		 323 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  68.11 
 
 		 323 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  62.62 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  61.2 
 
 		 322 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  59.49 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  55.66 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  59.26 
 
 		 324 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  59.26 
 
 		 324 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  57.05 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  57.28 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  53.85 
 
 		 328 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  54.63 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  50 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  54.17 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  53.21 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  55.84 
 
 		 323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  55.56 
 
 		 322 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  55.24 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  51.28 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  48.98 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  45.66 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  46.82 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0237  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  38.66 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0860272  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  43.73 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0645  immunogenic protein  40.88 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  43.49 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0394  putative immunogenic protein  39.35 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0147572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0649  DNA primase  42.52 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  40.57 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  39.04 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  40.2 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.05 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  38.89 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  34.78 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  36.27 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  38.03 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  35.78 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.42 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.66 
 
 		 350 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  34.87 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.87 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2692  immunogenic protein family protein  35.23 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.99 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  31.83 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.6 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0290  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.66 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4560  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.56 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1853  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.32 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.45766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.78 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2942  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.02 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.89 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.33 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.99 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.66 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0431  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.41 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4400  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.87 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.23 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5002  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.57 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117483  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.15 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.56 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  28.88 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.48 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.19 
 
 		 651 aa  149  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.4 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.4 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.4 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.4 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2878  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.01 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.082119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  29.9 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.66 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  30.17 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.55 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.83 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.83 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3954  periplasmic binding protein, putative  29.43 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.38 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2949  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.61 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0937  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.73 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1256  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.69 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.34 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0881  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.38 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.000456072  normal  0.0650778 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2329  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.9 
 
 		 349 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.43 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.49 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.12 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1229  putative immunogenic protein precursor  30.93 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0874  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.87 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4160  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.43 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3267  hypothetical protein  31.61 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000812  immunogenic protein  29.91 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06717  hypothetical protein  29.09 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0358  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.28 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0105489  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.72 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>