More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2690 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 150 aa  306  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  87.92 
 
 		 179 aa  270  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  87.25 
 
 		 149 aa  269  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  79.87 
 
 		 149 aa  249  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  74.83 
 
 		 149 aa  227  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  71.62 
 
 		 149 aa  224  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  71.14 
 
 		 151 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  75.52 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  75.52 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  70.67 
 
 		 148 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 144 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  70.67 
 
 		 153 aa  215  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  74.83 
 
 		 144 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0534  3-dehydroquinate dehydratase  71.92 
 
 		 148 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000293709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  73.43 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  73.72 
 
 		 161 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  72.41 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  72.41 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  72.41 
 
 		 146 aa  210  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  73.24 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  67.35 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.33 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  65.99 
 
 		 150 aa  206  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  67.59 
 
 		 146 aa  204  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  67.32 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  70.75 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  69.44 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  68.06 
 
 		 146 aa  194  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3285  3-dehydroquinate dehydratase  75.38 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.44 
 
 		 150 aa  193  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  69.44 
 
 		 150 aa  193  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  71.13 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  71.13 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  68.06 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  69.06 
 
 		 148 aa  190  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0393  3-dehydroquinate dehydratase  73.02 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1203  3-dehydroquinate dehydratase  73.02 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.802728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0460  3-dehydroquinate dehydratase  73.02 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.480459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4416  3-dehydroquinate dehydratase  72.44 
 
 		 150 aa  187  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0161291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0255  3-dehydroquinate dehydratase  67.69 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  67.61 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0245  3-dehydroquinate dehydratase  69.05 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  64.58 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  66.19 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  64.86 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 207 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  65.52 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  67.61 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 207 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 207 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3840  3-dehydroquinate dehydratase  64.62 
 
 		 150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0684157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3682  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.46 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  62.07 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  63.64 
 
 		 145 aa  176  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  62.84 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  63.77 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  63.45 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 155 aa  173  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  62.07 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  63.83 
 
 		 167 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 150 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.42 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0370  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  60.9 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  62 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  62 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1053  3-dehydroquinate dehydratase  64.49 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000105156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  64.75 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  59.29 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0445  3-dehydroquinate dehydratase  60.84 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.26 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3689  3-dehydroquinate dehydratase  60.69 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  62.22 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0050  3-dehydroquinate dehydratase  62.99 
 
 		 167 aa  164  2.9999999999999998e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.312759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  60.9 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  56.3 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>