More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2619 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1231    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 		 282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 		 271 aa  139  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 224 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  33.33 
 
 		 239 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.44 
 
 		 279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 278 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 238 aa  117  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 		 238 aa  117  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 234 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 289 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  31.2 
 
 		 233 aa  107  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.83 
 
 		 261 aa  107  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 251 aa  107  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  31.2 
 
 		 233 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  29.28 
 
 		 233 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 274 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.74 
 
 		 257 aa  100  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 		 249 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 		 297 aa  97.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 256 aa  95.9  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 253 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.91 
 
 		 306 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 249 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.36 
 
 		 306 aa  94.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.87 
 
 		 318 aa  94.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.45 
 
 		 373 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 244 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 244 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 244 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  30.92 
 
 		 270 aa  91.3  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 239 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 254 aa  90.9  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 		 255 aa  90.5  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 1015 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 322 aa  88.6  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  87.8  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0316  polysaccharide deacetylase-like protein  29.36 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0303  polysaccharide deacetylase-like protein  29.36 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0331  polysaccharide deacetylase-like protein  29.36 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 		 336 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0363  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 367 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.99 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.73 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 264 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4976  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  27.19 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0404  polysaccharide deacetylase-like protein  29.2 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.606713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0360  polysaccharide deacetylase-like protein  29.2 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.03 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0298  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0310  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  26.8 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4943  polysaccharide deacetylase-like protein  28 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0377  polysaccharide deacetylase-like protein  28 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  27.42 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  29.07 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 349 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 283 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0309  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.11 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  23.84 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 712 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 712 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0625  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0292231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 318 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  26.56 
 
 		 724 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 		 645 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  23.72 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.41 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  24.39 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  24.19 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6088  polysaccharide deacetylase  22.3 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>