More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2606 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 357 aa  736    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  65.61 
 
 		 351 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  63.28 
 
 		 340 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  53.94 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  48.3 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  48.3 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  47.95 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  48.25 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  47.95 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  46.7 
 
 		 347 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  49.4 
 
 		 340 aa  335  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  46.97 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 		 347 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  48.96 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  48.66 
 
 		 340 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  48.35 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  46.94 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  46.51 
 
 		 350 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  45.4 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  47.63 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 342 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  44.54 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  43.27 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  43.38 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  42.18 
 
 		 357 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  38.44 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 		 350 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  40.43 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  39.76 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.92 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  36.92 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  35.86 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  35.86 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.6 
 
 		 779 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.91 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.03 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  26.48 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.82 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.51 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.81 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.79 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.41 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.81 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.81 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.81 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.81 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.81 
 
 		 390 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.69 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.48 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  25.49 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.56 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.56 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.25 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 475 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  31.75 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  21.63 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.43 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  25.17 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.66 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.94 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  25.25 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.72 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.52 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.41 
 
 		 367 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.23 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  28.16 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3149  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  24.92 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.15 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.15 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.73 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4392  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.747454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.07 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.94 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.38 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>