More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2453 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 126 aa  249  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  79.2 
 
 		 127 aa  201  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  77.6 
 
 		 127 aa  197  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  65.6 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  53.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  51.24 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  52.68 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  54.46 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  50.89 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  57.3 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  49.11 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  46.43 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  45.54 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.75 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  42.59 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  38.89 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.17 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  53.66 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  47.52 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.67 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  39.47 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.16 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  35.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.74 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.79 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.61 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.61 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.46 
 
 		 193 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  40.87 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.2 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.2 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.79 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  32.77 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  40.71 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  31.19 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.18 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  41.41 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  28.81 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.56 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>