More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2445 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  100 
 
 		 400 aa  791    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  76.15 
 
 		 423 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  75.06 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  64.78 
 
 		 401 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.43 
 
 		 400 aa  323  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  45.96 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.52 
 
 		 400 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.67 
 
 		 400 aa  315  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.45 
 
 		 400 aa  308  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.27 
 
 		 402 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.78 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  44.78 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.78 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.78 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.41 
 
 		 402 aa  298  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.41 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.3 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.29 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  44.85 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.78 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  45.15 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.6 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.99 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.7 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.46 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.89 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.27 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.09 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.57 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  31.2 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  31.01 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  31.2 
 
 		 395 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  31.01 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  31.01 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.42 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1320  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.15 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1232  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.42 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  33.43 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.25 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.48 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  31.75 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  30.14 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  31.14 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  31.55 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  31.25 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.96 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.61 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.32 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 396 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  31.98 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.05 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2505  hypothetical protein  32.2 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1335  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.61 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.409904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  30.89 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.87 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.53 
 
 		 415 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.2 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  35.93 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.65 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.2 
 
 		 411 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3550  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.98 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.16 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.34 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.5 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.53 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.33 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.42 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.42 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.42 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.15 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.76 
 
 		 400 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.48 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.29 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_0624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.9 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.81 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.18 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3096  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.77 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673947  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0898  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.9 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.47 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.81 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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