118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2438 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2438  universal stress protein A  100 
 
 		 141 aa  288  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001946  universal stress protein A  76.6 
 
 		 141 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00532  universal stress protein  76.6 
 
 		 141 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2946  universal stress protein A  70.21 
 
 		 141 aa  210  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4114  UspA domain protein  58.87 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4201  UspA domain protein  59.57 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4484  UspA domain protein  59.57 
 
 		 145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4035  universal stress protein A  58.87 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4090  universal stress protein A  58.87 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0120  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 148 aa  186  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.792174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4691  UspA domain-containing protein  58.16 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03344  universal stress global response regulator  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0220  UspA domain protein  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03297  hypothetical protein  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3695  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3977  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0221  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3784  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3827  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4841  universal stress protein A  58.87 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3861  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0446526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3904  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3784  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0353489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3794  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3965  universal stress protein A  58.16 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3927  UspA domain protein  58.16 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3909  UspA domain-containing protein  58.16 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1121  universal stress protein A  51.8 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001381  universal stress protein family 8  49.65 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000691396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06392  hypothetical protein  48.94 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0955  universal stress protein  52.82 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0959  universal stress protein  42.18 
 
 		 148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0125  universal stress protein  43.97 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0954  universal stress protein  41.84 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1234  universal stress protein  43.66 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1969  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0857578  hitchhiker  0.00755954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2471  universal stress protein UspC  38.03 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000143058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000133  universal stress protein family 2  36.88 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0671042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1452  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2632  universal stress protein UspC  34.04 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00097653  hitchhiker  0.0000000000000132668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2088  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0115018  hitchhiker  1.03858e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2082  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.025537  decreased coverage  0.000000291933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1194  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000126998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1317  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  hitchhiker  3.24254e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2143  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0567863  hitchhiker  5.63035e-26 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03808  stress-induced protein  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4062  UspA domain protein  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03757  hypothetical protein  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4154  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4457  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4095  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4405  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01864  universal stress protein  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.113188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01853  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1992  universal stress protein UspC  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000020089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2127  universal stress protein UspC  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000153827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1739  universal stress protein UspC  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.342522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1290  universal stress protein UspC  34.04 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000158426  hitchhiker  0.0000000604455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5378  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4363  universal stress protein UspD  32.62 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.54659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1747  UspA domain protein  34.04 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.17703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2991  universal stress protein UspC  34.29 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  30.99 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  27.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  27.89 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  29.17 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  27.89 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2982  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  28.67 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  26.81 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  26.81 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  28.67 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  32.46 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2414  UspA domain protein  28.47 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  25.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  27.4 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  26.9 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.97 
 
 		 294 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  26.06 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  26.39 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  27.78 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  25.53 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>