205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2417 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  100 
 
 		 277 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  65.59 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  66.3 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2898  integral membrane protein  60.44 
 
 		 279 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.345638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  45.68 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  45.68 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  48.5 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  45.96 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  45.56 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  45.49 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  43.38 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  44.98 
 
 		 280 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  44.28 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  44.65 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  44.28 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  41.97 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  44.07 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  41.97 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  41.97 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  41.64 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  41.24 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  40.51 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  43.01 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  43.8 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  42.65 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  42.03 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  40.81 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  40.81 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  40.81 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  40.74 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  40.74 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  41.45 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  43.43 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  40.74 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  42.22 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  39.63 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3467  membrane serine peptidase  39.49 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  39.78 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  37.63 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  38.57 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0162  rhomboid family GlpG protein  33.98 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562352  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1385  Rhomboid family protein  27.89 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2197  rhomboid-like protein  31.83 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2164  rhomboid family protein  44.67 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  41.55 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  36.27 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  32.25 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  32.63 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  33.05 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  39.71 
 
 		 224 aa  95.9  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  31.93 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2052  hypothetical protein  32.27 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00391881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  42.55 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34050  Rhomboid family membrane protease  38.42 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24240  hypothetical protein  31.69 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00172141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  31.67 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2942  rhomboid family protein  35.86 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00975184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  28.74 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  29.55 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  27.81 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  29.71 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  26.67 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  28.8 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  26.28 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  26.28 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  28 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  28.57 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  28.07 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.98 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  28.9 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  28.22 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  27.61 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  31.98 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  31.94 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  24.64 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  31.62 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  29.57 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  31.79 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  28.72 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  27.52 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  31.25 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  33.08 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  29.08 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  40.3 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  25.19 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.19 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  27.53 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  25.3 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>