More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2415 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2415  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000025534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  73.91 
 
 		 253 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  74.5 
 
 		 265 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  73.52 
 
 		 254 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  54.37 
 
 		 256 aa  298  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  51.38 
 
 		 256 aa  294  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2173  Sec-independent protein translocase TatD  46.83 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.69531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5476  hydrolase, TatD family  47.41 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.230382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  45.85 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2234  hydrolase, TatD family  47.27 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154298  normal  0.291214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  45.06 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  43.87 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  41.47 
 
 		 263 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_002950  PG0783  hydrolase, putative  40.94 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.86 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.86 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.86 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.47 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  36.61 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  36.19 
 
 		 462 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.08 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.08 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.69 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  37.11 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.16 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.69 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.08 
 
 		 458 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  39.06 
 
 		 457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 458 aa  182  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  40.62 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  36.47 
 
 		 606 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  36.86 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  39.37 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  36.86 
 
 		 461 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  39.68 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  36.12 
 
 		 462 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  37.31 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04351  putative deoxyribonuclease, TatD family  37.98 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.65 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  35.36 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  34.38 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.59 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  35.69 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  34.78 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  36.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  36.72 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  33.33 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  33.2 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  34.38 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  33.2 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  33.85 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.33 
 
 		 464 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  36.22 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.55 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1192  YabD  35.14 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.937754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  34.62 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  35 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  35.41 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  34.62 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  34.48 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  34.9 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  33.46 
 
 		 459 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  32.14 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  34.12 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  34.63 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  33.46 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16661  TatD family deoxyribonuclease  33.97 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  38.58 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  34.36 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  37.02 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 278 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  35.04 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  34.65 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  34.77 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  34.11 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1353  hypothetical protein  34.1 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  32.42 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  32.55 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16081  TatD family deoxyribonuclease  33.07 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>