299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2383 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  838    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  65.35 
 
 		 407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  62.96 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  52.23 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  47.19 
 
 		 400 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  45.79 
 
 		 404 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  43.81 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  38.97 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  41.18 
 
 		 409 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  37.09 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  36.34 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  34.63 
 
 		 408 aa  275  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  35.48 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  38.48 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  35.91 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  35.66 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  35.68 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  37.03 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  33.25 
 
 		 411 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  34 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 		 413 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  32.67 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  33.74 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  31.87 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  31.68 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.56 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 423 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  32.35 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.25 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  30.02 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 419 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  32.11 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.6 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  28.26 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.05 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  31.51 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  29.52 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  28.22 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  30.71 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  32.62 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  32.34 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.07 
 
 		 487 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  29.98 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  31.28 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  29.73 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  26.7 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  28.19 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  27.65 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  28.08 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  27.34 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  29.82 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  29.78 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  27.52 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  25.62 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  27.52 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  27.61 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  26.41 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  26.41 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  29.67 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.73 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  26.85 
 
 		 449 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.99 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  27.78 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  26.11 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26.65 
 
 		 407 aa  126  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  28.02 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  26.09 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.35 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  26.57 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  27.42 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.84 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  23.1 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  29.83 
 
 		 378 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  26.75 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  24.15 
 
 		 439 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  27.59 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  24.31 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  22.98 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  30.32 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  23.59 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  23.35 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  24.24 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  24.72 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  22.61 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  22.61 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  28.03 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  29.15 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  32.28 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  29.96 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>