More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2341 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  100 
 
 
535 aa  1101    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  54.81 
 
 
534 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  56.16 
 
 
489 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.33 
 
 
630 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51 
 
 
629 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.6 
 
 
629 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51 
 
 
629 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.8 
 
 
629 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.79 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.04 
 
 
540 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  50.52 
 
 
524 aa  362  9e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1522  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48.34 
 
 
402 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.858341  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  47.87 
 
 
403 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176221  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  50.27 
 
 
586 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13460  subtilisin-like serine protease  47.23 
 
 
403 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 
514 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  47.87 
 
 
663 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  46.51 
 
 
596 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.17 
 
 
514 aa  329  8e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.38 
 
 
558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.45 
 
 
519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.8 
 
 
391 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.82 
 
 
484 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4308  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.28 
 
 
380 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.6 
 
 
597 aa  316  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  44.23 
 
 
601 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1838  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.1 
 
 
519 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0716705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.92 
 
 
563 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.54 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.93 
 
 
518 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.22 
 
 
519 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1037  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.29 
 
 
393 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.22 
 
 
427 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2054  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.8 
 
 
407 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0029  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.48 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.9 
 
 
404 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.600934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3063  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 
833 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561591  normal  0.891031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.25 
 
 
377 aa  263  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2268  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
507 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.0271027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1717  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.06 
 
 
381 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2269  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.8 
 
 
461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.778693  normal  0.0483153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2666  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.69 
 
 
731 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785102  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3551  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 
396 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00861424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  44.06 
 
 
801 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2843  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.16 
 
 
404 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0208392  normal  0.0563456 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_4493  predicted protein  37.73 
 
 
449 aa  248  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0320757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2012  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.63 
 
 
514 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  41.83 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.06 
 
 
442 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.883055  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1252  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.62 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.963928  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  42.93 
 
 
472 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  38.41 
 
 
460 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48491  predicted protein  41.39 
 
 
401 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131645  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  37.96 
 
 
521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3798  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.31 
 
 
522 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.35 
 
 
395 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78783  vacuolar protease B  37.56 
 
 
544 aa  230  6e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0089514  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5785  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.22 
 
 
401 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00620  serine-type endopeptidase, putative  36.44 
 
 
518 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  38.28 
 
 
551 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  37.08 
 
 
555 aa  223  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  38.69 
 
 
582 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48484  predicted protein  38.72 
 
 
380 aa  220  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00786628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10030  hypothetical serine protease (Eurofung)  33.56 
 
 
477 aa  219  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.632842  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05558  Alkaline proteasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00208]  36.2 
 
 
403 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.92 
 
 
514 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0802197  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.27 
 
 
407 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28842  predicted protein  37.01 
 
 
398 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991697  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  35.1 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
407 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264127  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.31 
 
 
583 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.7 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.83 
 
 
399 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  43.14 
 
 
1315 aa  163  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.99 
 
 
396 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14380  predicted protein  38.46 
 
 
247 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.55072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  31.57 
 
 
560 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.12 
 
 
520 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  28.32 
 
 
533 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  34.07 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  33.8 
 
 
397 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  41.41 
 
 
891 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  34.34 
 
 
397 aa  153  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  34.34 
 
 
397 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  34.34 
 
 
397 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  34.34 
 
 
397 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  34.34 
 
 
397 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.55 
 
 
401 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  33.06 
 
 
397 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.33 
 
 
500 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.59 
 
 
617 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.6 
 
 
557 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  33.52 
 
 
397 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3530  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.49 
 
 
394 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410935  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.4 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3301  putative serine protease  34.44 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  33.45 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.83 
 
 
397 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  28.43 
 
 
620 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.35 
 
 
406 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>