53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2319 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  48.95 
 
 		 193 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  48.95 
 
 		 193 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  29.95 
 
 		 172 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  28.95 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  28.95 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  32.58 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  27.37 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  29.26 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  28.72 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  28.72 
 
 		 168 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  28.72 
 
 		 168 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  27.37 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  30.86 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  25.67 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  28.49 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  29.71 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  27.75 
 
 		 174 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  32.2 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  26.01 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  25.84 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  26.84 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  25.99 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  26.4 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  25.42 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  29.63 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  26.97 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  32.5 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  26.01 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  25.88 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  23.86 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  26.86 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  30.38 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  22.51 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  24.56 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  25.14 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  24.72 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  26.26 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  29.35 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  23.44 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  23.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  26.97 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  30.85 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  33.04 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  22.96 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  27.33 
 
 		 155 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  27.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  27.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>