73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2301 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  100 
 
 
117 aa  239  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  80.18 
 
 
111 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  78.18 
 
 
111 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  61.95 
 
 
125 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  39.83 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  40.68 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  39.83 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  40.68 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  39.83 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  38.14 
 
 
122 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  40.34 
 
 
121 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  38.79 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  35.34 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  42.31 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  39.66 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  40.54 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  37.29 
 
 
121 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  38.79 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  37.17 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  39 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  40.17 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  35.4 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  36 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  42.34 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  42.34 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  42.34 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  39.22 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  41.53 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  41.44 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  38.24 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  42.34 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  31.93 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  32.74 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  28.16 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  30.48 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.14 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  25.64 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  25.64 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  38.27 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.37 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 
136 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  31.25 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  35 
 
 
250 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  40 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  30.49 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  26.14 
 
 
96 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  34.41 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  38.24 
 
 
237 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2589  general secretion pathway protein I  30 
 
 
133 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 
116 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  35.09 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  27.03 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0603  general secretion pathway protein I  42.22 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  33.93 
 
 
146 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>