79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2298 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 403 aa  818    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  53.35 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  52.74 
 
 		 381 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  41.65 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  30.45 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  30.69 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  30.56 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  30.69 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  30.69 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  30.69 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  30.69 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  29.17 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  29.7 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  29.7 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  31.13 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  29.46 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  29.7 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  29.68 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  27.56 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  27.48 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  31.11 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  28.96 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  28.61 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  26.57 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  28.86 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  30.73 
 
 		 450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.32 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  28.18 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  24.61 
 
 		 379 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  25.5 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  24.46 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  25 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  24.65 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  23.21 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  25.67 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.99 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  24.32 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  23.75 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  19.78 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3527  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0380  general secretion pathway protein L  28.57 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  20.05 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03184  general secretory pathway component, cryptic  28.57 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03135  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  26.4 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  28.04 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  23.34 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  33.33 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  24.03 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  30.21 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  30.21 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  30.21 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  30.21 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  30.21 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  31.15 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  30.21 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  30.21 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  30.61 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  30.61 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  31.15 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  30.21 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4243  general secretion pathway L  24.1 
 
 		 364 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.07387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  28.12 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  20.82 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  20.82 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  24.54 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  27.84 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  32.93 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  32.93 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3308  Type II secretory pathway component PulL-like protein  25.77 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  28.28 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  21.82 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  27.37 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  34.95 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  30 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  26.92 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  29.09 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0389  general secretion pathway L  20.54 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.454509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>