130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2271 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2271  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
435 aa  854    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00155  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.74 
 
 
435 aa  709    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002213  C4-dicarboxylate transporter anaerobic  88.97 
 
 
435 aa  707    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  74.02 
 
 
433 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1910  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  74.38 
 
 
433 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0126461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  69.2 
 
 
433 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  66.9 
 
 
433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  70.98 
 
 
415 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  69.43 
 
 
433 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  69.43 
 
 
433 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  69.43 
 
 
433 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  71.07 
 
 
415 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  67.98 
 
 
433 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  63.62 
 
 
435 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  66.21 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  67.59 
 
 
433 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  66.05 
 
 
433 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  68.33 
 
 
433 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4686  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.34 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4743  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.34 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.722845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4595  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.34 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4603  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.34 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.34 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.88 
 
 
433 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3874  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4607  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.104112  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4667  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.65 
 
 
433 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.654313  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  57.97 
 
 
445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3679  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.91 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  51.7 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.678975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.91 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3826  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.91 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1912  hypothetical protein  55.73 
 
 
446 aa  441  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000048049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04830  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  63.05 
 
 
432 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.664542 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0390  IspD/IspF bifunctional enzyme  52.71 
 
 
447 aa  427  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.889279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1117  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.77 
 
 
444 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0139  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  54.43 
 
 
444 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0083  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.7 
 
 
442 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0123  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.93 
 
 
442 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0095  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  52.87 
 
 
442 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.82 
 
 
432 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2005  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.12 
 
 
433 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.95 
 
 
437 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.35 
 
 
437 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.35 
 
 
437 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.12 
 
 
437 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.12 
 
 
437 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.12 
 
 
437 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.58 
 
 
437 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.35 
 
 
437 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.67 
 
 
439 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.89 
 
 
437 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.12 
 
 
437 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.12 
 
 
437 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  42.24 
 
 
441 aa  328  8e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.24 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  44.6 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.56 
 
 
453 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  42.7 
 
 
443 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  42.6 
 
 
453 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.14 
 
 
453 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.42 
 
 
437 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  39.95 
 
 
439 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.41 
 
 
436 aa  301  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  40.64 
 
 
441 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0209  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  43.97 
 
 
423 aa  296  5e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.51 
 
 
442 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  35.44 
 
 
443 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.44 
 
 
443 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.34 
 
 
447 aa  286  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.41 
 
 
441 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.46 
 
 
441 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.18 
 
 
447 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  37.25 
 
 
446 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.4 
 
 
440 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.69 
 
 
447 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.53 
 
 
441 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.01 
 
 
438 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.69 
 
 
453 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.37 
 
 
438 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.1 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.1 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.1 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.1 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.24 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.24 
 
 
447 aa  253  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.24 
 
 
447 aa  253  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.43 
 
 
474 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3863  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.78 
 
 
446 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39327  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.19 
 
 
474 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.32 
 
 
447 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>