More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2178 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  100 
 
 
622 aa  1281    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  44.59 
 
 
607 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  44.81 
 
 
607 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  34.89 
 
 
613 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  33.83 
 
 
617 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  33.83 
 
 
617 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  36.54 
 
 
611 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  32.67 
 
 
609 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  34.66 
 
 
615 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  34.51 
 
 
647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  34.72 
 
 
638 aa  343  4e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  33.81 
 
 
635 aa  334  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  33.81 
 
 
638 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  32.5 
 
 
600 aa  327  4.0000000000000003e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  30.97 
 
 
637 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  31.13 
 
 
637 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  33.52 
 
 
625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  30.99 
 
 
624 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  29.23 
 
 
600 aa  253  7e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  29.1 
 
 
602 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  25.81 
 
 
601 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  30.65 
 
 
614 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  27.54 
 
 
602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  25.94 
 
 
593 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  25.74 
 
 
598 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  25.74 
 
 
598 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  25.74 
 
 
598 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  25.12 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  29 
 
 
641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  25.04 
 
 
595 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  30.68 
 
 
642 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  27.61 
 
 
595 aa  210  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  27.22 
 
 
604 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  24.27 
 
 
586 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  26.93 
 
 
594 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  24.27 
 
 
586 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  25.04 
 
 
586 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  24.27 
 
 
586 aa  203  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  24.88 
 
 
586 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  24.88 
 
 
586 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  24.88 
 
 
586 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  24.88 
 
 
586 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  25 
 
 
590 aa  198  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25.33 
 
 
596 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  25.16 
 
 
596 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  25.16 
 
 
596 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  26.41 
 
 
596 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  26.95 
 
 
595 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  24.63 
 
 
594 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  24.23 
 
 
582 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  26.15 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  24.76 
 
 
590 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  26.45 
 
 
595 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  26.45 
 
 
595 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  25.41 
 
 
596 aa  190  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  26.61 
 
 
595 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  26.45 
 
 
595 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  26.95 
 
 
594 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  25.33 
 
 
592 aa  181  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  24.1 
 
 
582 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  26.72 
 
 
621 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  26.45 
 
 
621 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  25.51 
 
 
621 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  25.79 
 
 
630 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  27.53 
 
 
784 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  26.45 
 
 
450 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  25.34 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  31.71 
 
 
657 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  23.65 
 
 
509 aa  64.3  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  26.15 
 
 
765 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.51 
 
 
493 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  25.25 
 
 
1009 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  26.1 
 
 
586 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  24.16 
 
 
545 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  24.25 
 
 
545 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  23.92 
 
 
545 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  21.99 
 
 
558 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  35.71 
 
 
543 aa  58.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  22.25 
 
 
497 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  27.54 
 
 
630 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  23.08 
 
 
557 aa  56.6  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1478  sulfatase  40.86 
 
 
558 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  21.58 
 
 
547 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  28.57 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  28.57 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  28.57 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  28.57 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  28.57 
 
 
628 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  22 
 
 
873 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  28.57 
 
 
628 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  39.13 
 
 
565 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  28.71 
 
 
522 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.63 
 
 
537 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  23.14 
 
 
649 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>