More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2094 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  89.92 
 
 		 129 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  88.37 
 
 		 129 aa  238  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  89.15 
 
 		 129 aa  238  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  79.07 
 
 		 128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  78.29 
 
 		 128 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  79.07 
 
 		 128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  79.07 
 
 		 128 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  78.29 
 
 		 128 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  78.29 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  75.19 
 
 		 129 aa  203  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  74.42 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  71.88 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  71.88 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  72.09 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  69.77 
 
 		 128 aa  187  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  68.99 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  68.99 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0543  putative endoribonuclease L-PSP  72.09 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0260  putative endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.61 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  51.56 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  51.56 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  51.97 
 
 		 126 aa  127  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  50.78 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  48.03 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>